Isto é do criador do Byobu (respondendo a alguma outra pergunta):
Comecei a escrever Byobu em dezembro de 2008, quando me encontrei com vários usuários do Screen e do Ubuntu Server no Googleplex e descobri que todos nós mantínhamos nosso próprio grupo de hacks legais/divertidos/úteis em nossas configurações ~/.screenrc .E tivemos que movê-los manualmente entre as dezenas ou centenas de servidores que usávamos. Começamos a trocar dicas e truques, e comecei a coletá-los no projeto GPLv3 original chamado "perfis de tela". Cerca de 6 meses depois, toda uma comunidade se desenvolveu em torno de "perfis de tela" e o projeto se tornou muito mais do que apenas hacks de tela - tínhamos utilitários de configuração, plug-ins de status ao vivo e atalhos de teclado.
Eu normalmente uso o tmux e também acho irritante que cada servidor em que faço login tenha sua própria configuração do tmux (especialmente combinações de teclas!). Como posso fazer com que o byobu use a mesma configuração em todos os lugares?
Não tenho certeza se isso é relevante, mas geralmente uso tmuxes aninhados (minha máquina/servidor).
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Esse problema não é realmente específico de byobuor tmux. Contanto que você tenha preferências pessoais sobre como as coisas devem funcionar, você terá que gerenciar seu próprio conjunto de dotfiles.
Existem muitas estratégias que as pessoas usam para fazer isso. Aqui estão alguns links/perguntas relacionadas:
http://vcs-home.branchable.com/
https://unix.stackexchange.com/questions/1875/tips-for-putting-under-source-control
Há muito mais se você pesquisar por "controle de versão do diretório inicial" ou "controle de versão dotfile".