PyMOL possui um plugin chamado ferramenta APBS (http://www.pymolwiki.org/index.php/Apbsplugin) que requer três entradas de arquivo diferentes:
- Binário APBS (apbs.exe)
- Arquivo APBS psize.py
- Arquivo PDB2PQR pdb2pqr.py
Instalei o APBS e tenho apbs.exe e psize.py em meu diretório C:\APBS. PDB2PQR é o problema, baixeihttp://sourceforge.net/projects/pdb2pqr/files/latest/download(versão 2.0.0 para Windows de 64 bits) extraiu seu conteúdo e não conseguiu encontrar nenhum arquivo pdb2pqr.py no diretório extraído. Também tentei baixar o tarball pdb2pqr 1.8.0 (.tar.gz) e extrair seu conteúdo, pois fui informado em uma lista de discussão de usuários do PyMOL que ele deveria conter um arquivo pdb2pqr.py e pode ser mais compatível com o PyMOL. Mas esse tarball é o código-fonte e deve ser compilado, o que não é possível no Windows 7, que eu saiba.
Responder1
http://www.poissonboltzmann.org/
Este seria o método mais produtivo de obter sua resposta com um bate-papo na seção de ajuda técnica e suporte. Quanto à compilação no Windows 7, sim, é possível desde que você tenha o código-fonte COMPLETO e o arquivo de rotina de compilação.
Você pode encontrar uma falha no software porque o Windows 7 NÃO aceita drivers não assinados, além de instalar no diretório raiz, o que é uma má ideia, pois o Win 7, 8 e assim por diante possuem blocos para instalações do tipo legado no diretório raiz .
Pessoalmente, eu gostaria de fazer uma alteração na instalação e ver se você consegue instalá-la no diretório principal de arquivos de programas ou arquivos de programas x86, se for um software de 32 bits.
Talvez seja necessário alterar os recursos de segurança da unidade para permitir que a instalação ocorra. Leia as notas da Microsoft sobre isso antes de continuar e verifique qualquer codificação antes de compilar. Se for um sistema baseado em servidor Linux/Unix, uma instalação dupla de servidor Ubuntu virtual pode ser útil para você.
Esta é uma informação geral, pois não tenho conhecimento do uso ou do sistema de arquivos em questão e deve ser considerada um conselho. Em caso de dúvida fale com o fabricante e procure ajuda deve ser sempre sua primeira parada.