Eu me pergunto isso há algum tempo. Pessoalmente, acho que System32 faria sentido ser o sistema operacional Windows de 32 bits. Mas quando você tem um sistema operacional Windows de 64 bits, o sistema de arquivos ainda é chamado System32. Alguém pode me explicar por que isso acontece e por que a Microsoft faz dessa maneira?
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Compatibilidade com versões anteriores.
Quando a Microsoft lançou o primeiro sistema operacional de 64 bits, os únicos programas de 64 bits vieram com o sistema operacional. Como o MS Office não foi atualizado, o sistema operacional precisava suportar programas de 32 bits. Desde a instalação dos arquivos de sistema esperados do MS Office em \$Windows$\system32, o diretório precisava permanecer.