Minha instalação original do Windows 7 estava na minha unidade C (um SSD) e de alguma forma ficou corrompida e não inicializável.
Depois de executar a Ferramenta de Reparo de Inicialização, uma nova pasta do Windows foi criada em D:\, e o sistema será inicializado a partir daí - mas é claro que é muito lento. Todos os programas foram vinculados corretamente e funcionam.
O C:\Windows original ainda existe, mas a inicialização a partir daí falha.
Existe uma maneira de mover a pasta do Windows de volta para onde estava? Tenho muitos softwares instalados em ambas as unidades, portanto não há espaço suficiente para clonar um disco inteiro.