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É um bug conhecido (pelo menos para mim).
Isso pode ser causado por fakelinks e fakefolders (também conhecidos como links simbólicos) ou por arquivos temporários corrompidos que apareceram devido a erros críticos repentinos ou BSODs.
De qualquer forma, eu uso um gerenciador de arquivos decente para ver o que está acontecendo.
No seu caso, a primeira coisa a fazer é verificar se há erros no disco. Se as estimativas mostrarem o mesmo, ignore e prossiga com a limpeza.
Observe que não uso esse recurso porque é incompleto e insuficiente para minhas necessidades. Em vez disso, criei meu próprio arquivo .bat que descontaminará a unidade do sistema operacional de todo o lixo possível.