Tenho lido o ntfsclonemanualmas ainda consigo entender e ver o sentido de fazer uma clonagem apenas de metadados? Qual é o sentido disso, quando pode ser valioso? Presumo que "metadados" sejam apenas informações sobre os objetos do sistema de arquivos (por exemplo, pastas e arquivos), mas não os objetos em si.
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Pode ser útil recuperar-se de corrupção do sistema de arquivos.
Quando você formata c: ou exclui arquivos acidentalmente, os metadados são o que você perde primeiro e sem metadados, é um processo muito difícil restaurar/desfazer a exclusão/recuperar arquivos individuais ou sistemas de arquivos inteiros.
No entanto, seria fácil se você tivesse um clone de metadados. Ele fornece instantaneamente um sistema de arquivos montável intacto. Quanto aos conteúdos, eles ainda estariam lá, se não tivessem sido sobrescritos/descartados no incidente e não realocados desde que foi feito o backup dos metadados.
Claro, ainda é muito melhor ter um backup real (metadados + conteúdo) que sobreviva a falhas de unidade e similares.