Estou tentando instalar lintrno macOS 10.12.6 (com R 3.4.3 instalado via Homebrew), mas a instalação falha em um subpacote chamado igraph. Aqui está o erro:
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/opt/gcc/lib/gcc/7/gcc/x86_64-apple-darwin16.7.0/7.2.0'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/opt/gcc/lib/gcc/7/gcc/x86_64-apple-darwin16.7.0/7.2.0'
ld: file not found: /usr/lib/system/libsystem_darwin.dylib for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make: *** [igraph.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘igraph’
* removing ‘/usr/local/lib/R/3.4/site-library/igraph’
Como posso corrigir esse erro e fazê-lo funcionar?
Responder1
Enfrentei um aviso e um erro ao instalar esta biblioteca. Primeiramente eu tinha instalado no meu sistema uma versão mais recente do gcc (7.3.0), então fiz um link simbólico para a versão instalada:
ls -la /usr/local/opt/gcc/lib/gcc/7/gcc/x86_64-apple-darwin16.7.0/
Encontrei apenas a versão 7.3.0 instalada, então fiz:
ln -s /usr/local/opt/gcc/lib/gcc/7/gcc/x86_64-apple-darwin16.7.0/7.3.0 /usr/local/opt/gcc/lib/gcc/7/gcc/x86_64-apple-darwin16.7.0/7.2.0
Então eu tive que consertar também ld: file not found: /usr/lib/system/libsystem_darwin.dylib for architecture x86_64. Para isso executei:
sudo xcode-select -s /Library/Developer/CommandLineTools
Então executando novamente a instalação, deve funcionar.