Percebi que após a desinstalação de alguns programas, eles deixam pastas vazias no c:\windows\assembly\(Windows 7).
Embora não haja mal nenhum em manter essas pastas, quero manter as coisas organizadas e limpar o lixo não utilizado.
É seguro excluir essas pastas vazias?
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A pasta C:\Windows\Assembly é o Global Assembly Cache (GAC) usado pelo .NET Run time.
Geralmente, é aconselhável usar o comando .NET gacutil (https://docs.microsoft.com/en-us/dotnet/framework/tools/gacutil-exe-gac-tool) para gerenciar o conteúdo desta pasta.
Porém, se você acha que há alguma pasta vazia, você pode excluí-la. Se você excluir qualquer pasta não vazia, poderá criar o problema de execução de programas baseados em .NET em sua máquina.
Observe que você precisará de direitos de administrador para excluir qualquer conteúdo desta pasta (mesmo que seja uma pasta vazia).