Às vezes, meu GUIfica pegajoso. Em muitos aplicativos, a rolagem e a digitação ocorrem com pausas inexplicáveis.
Como saber qual aplicativo faz isso?
Pode haver troca de teclado, captura de tela, bloqueador de anúncios (no navegador)?
A carga da CPU está baixa.
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Eu começaria com o gerenciador de tarefas ou monitor de recursos e procuraria outras coisas além da CPU (principalmente memória e disco).
Aposto que o problema está relacionado ao uso do disco (talvez você esteja ficando sem memória e usando o arquivo de troca ou talvez as atualizações do Windows estejam sendo executadas em segundo plano).