Eu preciso apenas de 80 GB de memória para meu servidor, o que preencheria 5 slots dos 6 na minha placa-mãe z9pe-d8 ws e queria saber se eu teria problemas de desempenho por não preencher o último slot?
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Não, não deve haver nenhum problema de desempenho.
Para o último stick você não pode usar a opção de canal duplo quepoderiaaumente um pouco o desempenho, mas como você já está usando canal duplo para os outros quatro sticks, você não deverá ter problemas de desempenho, pelo menos no que diz respeito à RAM.