awk para extrair um padrão específico no arquivo com base na correspondência de variáveis

Question

Abaixo awkestou tentando extrair o valor de RSTRINGcom base em onde o valor de outra variável $VCFé encontrado em a file. O valor de $VCFjá foi extraído e RSTRINGatualmente são todas as linhas começando com R_2019. O que estou tentando obter é RSTRINGdefinido com base em onde $VCFfoi encontrado. Obrigado :).

arquivo

xxx_0000 19-0004-La-Fi
xxx_0001 19-0005-Last-Firs
xxx_0003 19-0008-LastN-FirstN
xxx_0005 190320-Control
R_2019_00_00_xxxx-000-v5.6_xxxxx

xxx_0007 19-0000-LastName-FirstName
xxx_0009 19-0001-Las-Fir
xxx_0011 190319-Control
R_2019_00_00_xxxx-00-v5.6_xxxxx

Se$VCF=19-0008-LastN-FirstN

desejado

RSTRING=R_2019_00_00_xxxx-000-v5.6_xxxxx

Se$VCF=19-0008-Las-Fir

desejado

RSTRING=R_2019_00_00_xxxx-00-v5.6_xxxxx

estranho

awk -v ref="$VCF" 'match($0, ref) {print "$RSTRING"}' file

Answer 1

Duas opções:

1. lendo o arquivo linha por linha, defina um sinalizador booleano ao encontrar o VCF e imprima opróximoRSTRING:

   awk -v ref="$VCF" '
       $0 ~ ref {have_vcf = 1}
       have_vcf && /^R_2019/ {print; have_vcf = 0}
   ' file
   

2. leia o arquivo por parágrafos. Se o registro atual contiver o VCF, imprima o último campo do registro:

   awk -F '\n' -v RS="" -v ref="$VCF" '$0 ~ ref {print $NF}' file