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Não há pacote npm para MSYS2/MINGW disponível.
Você deve instalar mingw-w64-x86_64-nodejs
o que vem com o npm
, mas provavelmente é suficiente para você por si só.
Para 64 bits:
pacman -S mingw-w64-x86_64-nodejs
Para 32 bits:
pacman -S mingw-w64-i686-nodejs
Após a instalação, verifique no Terminal:
$ node -v
v6.11.0 (or whatever is the latest)
Observação: Se você estiver no Windows 10, você obterá uma experiência Linux melhor do que no MSYS2/MINGW instalando o Ubuntu (ou outro) da Microsoft Store.