Como atualizo um pacote R do Github dentro do Conda?

Como atualizo um pacote R do Github dentro do Conda?

Estou tendo um problema com o pacote r-repr no pacote r-essentials do Anaconda que me impede de executar código para séries temporais em um notebook jupyter, conforme descrito aqui no github do pacote:https://github.com/IRkernel/repr/issues/117

Felizmente, o link acima também vê esse problema corrigido com o commit 505a052 no repositório Github do pacote.

Infelizmente, não tive sucesso na implementação desta atualização - o conda não oferece esta atualização para o pacote r-repr, e quando tentei baixar o commit do conda conforme discutido aqui:https://stackoverflow.com/questions/19042389/conda-installing-upgrading-directly-from-github , não consegui fazê-lo funcionar, recebendo este erro:

 ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: 'C:\Users\Owner\Anaconda3\envs\tester\python.exe' -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'C:\\Users\\Owner\\AppData\\Local\\Temp\\pip-req-build-8fj3m_ve\\setup.py'"'"'; __file__='"'"'C:\\Users\\Owner\\AppData\\Local\\Temp\\pip-req-build-8fj3m_ve\\setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' egg_info --egg-base pip-egg-info
         cwd: C:\Users\Owner\AppData\Local\Temp\pip-req-build-8fj3m_ve\
    Complete output (5 lines):
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "C:\Users\Owner\Anaconda3\envs\tester\lib\tokenize.py", line 447, in open
        buffer = _builtin_open(filename, 'rb')
    FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Users\\Owner\\AppData\\Local\\Temp\\pip-req-build-8fj3m_ve\\setup.py'
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

Eu até tentei atualizar o pacote da mesma forma que faria no R ou R Studio (install.packages('repr')) em um notebook Jupyter rodando o kernel R, mas isso estragou toda a instalação do Anaconda.

Alguém sabe a melhor forma de instituir o commit em questão ou atualizar este pacote no conda?

Responder1

Se alguém estiver enfrentando esse problema com o pacote repr em execução em um notebook jupyter, descobri que a solução alternativa é não atualizar o pacote via github, nem instalar o modo cran normal (install.packages('repr')) de um notebook jupyter (como mencionei, isso arruinou minha instalação).

Em vez disso, descobri que instalar o RStudio no anaconda, iniciá-lo e usar install.packages('repr') a partir daí foi o que me permitiu atualizar o pacote com sucesso. Consegui então usar o mesmo notebook Jupyter sem problemas.

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