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Perl-valor mínimo e máximo

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Perl-valor mínimo e máximo

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Xm_ABL1 Geneious    extracted region    1   168 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3512970000000 -> 3514640000000"
Xm_ABL1 Geneious    extracted region    169 334 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3717850000000 -> 3719500000000"

parte do código perl

 if ($array[1] =~ /extracted region/){
            die "No CDS record for $key!\n" unless $metadata->{$key};
    (my $label = $array[7]) =~ s/.*region from (.*)\|;.*/$1/;
    $label =~ s/\|/_/g;
    $group->{$label} ||= { 
            pos1 => 1e10,
            pos2 => 0,
            metadata => $metadata->{$key},
            sequences => [],
    };
    (my $pos1, my $arr, my $pos2) = ($array[7]=~/.*interval=\"(\d+) (<?->?) (\d+)\"$/gm);
    # capture hi/lo values for group
    $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if $pos1 < $group->{$label}->{pos1};
    $group->{$label}->{pos2} = $pos2 if $pos2 > $group->{$label}->{pos2};
    # push this sequence onto the group's array
    push(@{ $group->{$label}->{sequences} }, [ $pos1, $pos2, $arrow->{$arr} ]);
}

No código $pos1=3512970000000,3717850000000 e $pos2=3514640000000,3719500000000. Meu código imprime nova linha encontrando valor mínimo e máximo (se $pos1 for menor que 10.000), mas se o valor for maior que 10.0000 dá erro na impressão do valor mínimo de pos1. Qualquer ajuda é apreciada na depuração para encontrar o valor mínimo de $pos1 e o valor máximo de $pos2

Responder1

$group->{$label}->{pos1}está sempre definido, você o inicializou com a linha 6:

pos1 => 1e10,

para que funcione bem até $pos1 <= 1e10. Se você deseja imprimir o valor mínimo $group->{$label}->{pos1} = 3512970000000(como sua entrada de amostra), você deve inicializar $group->{$label}->{pos1} = -1(linha 6):

pos1 => -1,

e modifique a linha 13 com:

$group->{$label}->{pos1} = $pos1 if (($group->{$label}->{pos1} < 0) || ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

Responder2

alterando o código na Linha 13: usando defiend

 $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if ((!defined $group->{$label}->{pos1})
 ||  ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

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