Eu li a documentação tanto para as dicas de ferramentas sofisticadas quanto para a visualização sofisticadaaqui, e realmente não entendo quais são suas diferenças ou quando devo preferir um ao outro. Vejo que fantasiatooltips é um pacote TeX (um arquivo .sty), enquanto fantasia-preview é um script Perl. Mas eles parecem ter a mesma capacidade (que é a capacidade nas fotos doesta página.)
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Fancytooltips permitem inserir imagens (páginas do arquivo PDF externo) na página. O usuário deve preparar o arquivo externo euse comandos para inserir dicas de ferramentasno documento principal.
Fancy-preview cria o arquivo externo com dicas de ferramentasautomaticamentede equações, figuras, etc. e adiciona dicas de ferramentas a \refcomandos semelhantestambém automaticamente.
Ambos requerem pdflatex (pdflualatex também deve estar OK), mas em princípio é possível adicionar suporte também para xelatex.
Soluções semelhantes (adicionar material à página PDF e permitir botões para ocultar/revelar esse material) são ocg-x, ocg-pe ocgtoolsa macro \tooltipescrita por AlexG como resposta apdftooltip do pacote pdfcomment: Usando código LaTeX na dica de ferramenta. Nessas soluções, o código TeX para o tooptip está no arquivo TeX principal. ocgtoolsprecisa de pdflatex (é possível adicionar suporte também para xelatex), os demais pacotes e macros permitem rota xelatex ou dvips.
Pacotes semelhantes também são cooltooltipse pdfcomment. Esses pacotes não permitem nenhum código LaTeX nas dicas de ferramentas, mas o suporte em vários navegadores pode ser melhor.