No passado (TeXworks v0.4.0 r.759/MikTeX 2.9) usei a seguinte opção texify para informar o texify sobre a localização de arquivos de entrada adicionais:
--tex-option=-include-directory=C:\TexInputFiles\
Isso também fez com que o bibtex encontrasse arquivos .bib extras.
Agora, com a versão 0.4.6 (MiKTeX 2.9 64 bits), a mesma opção texify apenas permite que o latex passe encontre estilos adicionais e outros arquivos de entrada. Há um aviso LaTeX reclamando sobre "Ambiente 'thebibliography' vazio na linha de entrada XX" e relatórios bibtex (no arquivo .blg): "Não consegui abrir o arquivo de banco de dados XXX".
Posso usar -include-directory=C:\TexInputFiles\ para pdfLaTeX e para BibTeX individualmente e então invocar os passes manualmente fornece o resultado desejado, ou seja, o bibtex encontra os arquivos .bib.
No entanto, parece que o texify costumava passar o valor "--tex-option=" para o bibtex e também para o látex, mas agora só o faz para o látex. Isso é possível?
Existe alguma chance de consertar isso ou existe uma solução alternativa?
Tentei definir as variáveis de ambiente BIBINPUTS e TEXINPUTS para C:\TexInputFiles\ (e C:\TexInputFiles\) (em Sistema | Variáveis de ambiente | Variáveis de sistema), mas no Windows as variáveis de ambiente sempre parecem ser ignoradas.