Responder1
\shortstack
é realmente inadequado para empilhar caracteres uniformemente, pois leva em consideração apenas a altura e a profundidade do personagem, adicionando apenas 3 pontos entre eles.
Veja o resultado com
\documentclass{article}
\begin{document}
\shortstack{a\\c\\e}
\shortstack{g\\y\\q}
\shortstack{fg\\ly\\pt}
\shortstack{l\\a\\f}
\end{document}
O resultado certamente não é o que você esperava. O comando só é útil quando seu argumento consiste apenas em letras maiúsculas (sem diacríticos).
\documentclass{article}
\newcommand{\bettershortstack}[2][c]{%
\begin{tabular}[b]{@{}#1@{}}#2\end{tabular}%
}
\begin{document}
\bettershortstack{a\\c\\e}
\bettershortstack{g\\y\\q}
\bettershortstack{fg\\ly\\pt}
\bettershortstack{l\\a\\f}
\end{document}
E agora seu exemplo:
\documentclass{article}
\newcommand{\bettershortstack}[2][c]{%
\begin{tabular}[b]{@{}#1@{}}#2\end{tabular}%
}
\begin{document}
\bettershortstack{hoge \\ foo \\ bar}
\bettershortstack{hoge \\ \\ bar}
\end{document}
Responder2
Para que as coisas se alinhem corretamente, use a \vphantom
, já que as alturas das linhas são relativas à entrada:
\documentclass{article}
\usepackage{stackengine}
\begin{document}
\shortstack[c]{hoge \\ foo \\ bar}
\shortstack[c]{hoge \\ \\ bar}
\shortstack[c]{hoge \\ \vphantom{foo} \\ bar}
\end{document}