Estou procurando um comando para obter um arquivo neste formato:
hello 32
hello 67
hi 2
ho 1212
ho 1390
ho 3000
Para este formato (desduplicar pegando a última linha de um "grupo"):
hello 67
hi 2
ho 3000
No momento estou usando um trecho de Python e pandas:
df = pd.read_csv(self.input().path, sep='\t', names=('id', 'val'))
# how to replace this logic with shell commands?
surface = df.drop_duplicates(cols=('id'), take_last=True)
with self.output().open('w') as output:
surface.to_csv(output, sep='\t', cols=('id', 'val'))
Atualização: Obrigado pelas ótimas respostas. Aqui estão alguns benchmarks:
O arquivo de entrada tem 246 MB e contém 8583313 linhas. A ordem não importa. A primeira coluna tem um tamanho fixo de 9 caracteres.
Exemplo do arquivo de entrada:
000000027 20131017023259.0 00
000000027 20131017023259.0 11
000000035 20130827104320.0 01
000000035 20130827104320.0 04
000000043 20120127083412.0 01
...
time space complexity
tac .. | sort -k1,1 -u 27.43682s O(log(n))
Python/Pandas 11.76063s O(n)
awk '{c[$1]=$0;} END{for(... 11.72060s O(n)
Como a primeira coluna tem comprimento fixo, uniq -w
também pode ser usado:
tac {input} | uniq -w 9 3.25484s O(1)
Responder1
Isso parece loucura e espero que haja uma maneira melhor, mas:
tac foo | sort -k 1,1 -u
tac
é usado para reverter o arquivo, para que você obtenha o último em vez do primeiro.
-k 1,1
diz para usar apenas o primeiro campo para comparação.
-u
torna único.
Responder2
Se você não se importa com a ordem de saída, aqui está uma awk
solução:
$ awk '
{a[$1] = !a[$1] ? $2 : a[$1] < $2 ? $2 : a[$1]}
END {
for (i in a) { print i,a[i] }
}
' file
hi 2
hello 67
ho 3000
Responder3
Mais algumas opções:
perl
, se você não se importa com a ordem das linhas.perl -lane '$k{$F[0]}=$F[1]; END{print "$_ $k{$_}" for keys(%k)}' file
Um mais simples
awk
awk '{c[$1]=$0;} END{for(i in c){print c[i]}}' file
Uma concha boba
while read a b; do grep -w ^"$a" file | tail -n1 ; done < file | uniq