O sinal integral não aparece no projetor

Question 1

Você estava certo, este é o pacote que causou o problema

\usepackage[libertine,cmintegrals,cmbraces,vvarbb]{newtxmath}

Answer

Você estava certo, este é o pacote que causou o problema

\usepackage[libertine,cmintegrals,cmbraces,vvarbb]{newtxmath}

Question 2

Muito tarde, mas com esperança de que minha resposta ainda possa ajudar você ou outra pessoa.

Você tem sérios problemas com o preâmbulo do documento. É uma grande bagunça, muitos pacotes são carregados duas vezes ou mais, alguns pacotes como xcolor, hyperref, amsmath, já são carregados por by beamer, alguns pacotes são sensíveis à ordem de carregamento (por exemplo, clevereftinha que ser o último). Então, por favor, limpe o preâmbulo e, a cada pacote, pergunte-se se você realmente precisa dele (por exemplo IEEEtrantools).

Espera-se que em questão você forneça MWE (Exemplo Mínimo de Trabalho), ou seja, um documento pequeno, mas independente, que reproduza seu problema, algo como minha resposta abaixo (que desde o preâmbulo considera apenas pacotes relevantes para o seu problema).

A causa do seu problema (não ver sinais de integrais) é a ordem de carregamento dos pacotes dedicados às seleções de fontes. Se você avançar lmoderncom newtxmathas opções desejadas, obterá o resultado desejado.

Fora do assunto:

se você tiver uma equação no modo de exibição, as frações também estarão no modo de exibição, então você não precisa usar \dfrac, apenas \fracé suficiente
Não vejo motivo, aquele sinal de integral na última linha das align*equações é maior.
ao meu gosto é melhor deixar para o LaTeX escolher o tamanho certo da fração dos limites integrais
em vez de \onslide<1->{...}, etc é um mecanismo mais simples de usar, que é oferecido por itemize no beamer: \item<1->, \item<2->, etc

Um possível MWE:

\documentclass{beamer}

\usepackage{lmodern}
\usepackage[libertine,cmintegrals,cmbraces,vvarbb]{newtxmath}
\usepackage[scaled=0.95]{inconsolata}
\usepackage{nccmath}            % not used in MWE
\usepackage{amsthm, amssymb, latexsym}
\DeclareMathOperator{\ms}{ms}   % mean square
\DeclareMathOperator{\rms}{rms} % root mean square
\usepackage{relsize}            % not used in MWE, do you really need it?
        
        
\begin{document}

\begin{frame}{RMS Value}
    \begin{itemize}
\item<1-> Substitute Eq.1 to Eq.2:
    \begin{align*}
V_{\ms} & = \frac{1}{T} \int_{-\frac{T}{2}}^{\frac{T}{2}}v^2(t)dt       \\
        & = \frac{1}{T} \int_{-\frac{T}{2}}^{\frac{T}{2}} \frac{V^2_m}{2} dt
                + \frac{1}{T} \int_{-\frac{T}{2}}^{\frac{T}{2}}v^2(t)dt  \\
        & = \frac{1}{T} \int_{-\frac{T}{2}}^{\frac{T}{2}}
                        \frac{V^2_m}{2}\cos(2\omega+2\theta_v).
\end{align*}

\item<2-> The root mean square (RMS) value is the square root of the mean square value. For sinusoids, we have
    \[
V_{rms}=\frac{V_m}{2}= 0.7071V_m
    \]

\item<3->  Peak value from RMS value is: 
    \[
V_m =\sqrt{2}V_{\rms} = 1.4142 V_{\rms}
    \]
\end{itemize}

\end{frame}
\end{document}

que no último slide dá:

Tomei a liberdade e reformatei ligeiramente suas equações (não tenho certeza de sua validade, a segunda linha align*é suspeita para mim).

Answer