Como entrar no modo apêndice ao usar a opção \prl na documentclass? De acordo com as instruções que você coloca \appendixno código e tudo o que segue é tratado como um apêndice. Mas isso não parece fazer nada, nem faz \begin{appendix}...\end{appendix}.
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Se você tiver a prlopção habilitada na declaração da documentclass, não haverá números de seção, incluindo prefixos de apêndice. Com esta opção removida, eles aparecem normalmente.