É possível usar atalhos globais na GUI dedicada.
Também é possível para os atalhos personalizados?
Uma opção semelhante à acima não está presente na GUI do KDE4 para atalhos personalizados.
Mas imagino que deva haver algum arquivo para fazer backup.
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Os atalhos personalizados parecem não ter sido salvos como um esquema geral, mas como grupos separados de atalhos.
Na janela Atalhos personalizados, selecione Editar - Novo grupo, se você ainda não tiver um ou mais.
Marque para ativar o grupo e arraste e solte os atalhos que você já possui no grupo.
Para salvar um grupo, clique com o botão direito sobre ele e exporte:
