Eu tenho o Ubuntu 12.04.05 LTS. Eu baixei o ubuntu-16.04-desktop-amd64.iso. Quando executo o "Startup Disk Creator" e seleciono ubuntu-16.04-desktop-AMD64.iso para gravar no meu pendrive. Então eu reinicio, altero meu BIOS para inicializar a partir do SANDISK USB. Acabo em um CD ao vivo do Ubuntu 12.04. Que é o que eu já tenho. Eu sei que estou executando no pendrive porque minha área de trabalho está limpa e minha imagem de fundo está faltando. Os detalhes das configurações do sistema mostram o Ubuntu 12.04 LTS.
Usei o gparted para criar partições em outro pendrive e usei o dd para copiar o arquivo iso para o dispositivo USB. Em seguida, reiniciei, selecionando novamente o SANDISK USB no BIOS. E acabe em um drive USB ao vivo do Ubuntu 16.04 LTS. Mas se estou tendo esse problema, talvez outros também estejam?
Por alguma razão, parece que o Startup Disk Creator para Ubuntu 12.04 não grava o arquivo iso selecionado? Além disso, o SDC não mostra um número de versão.
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Startup-Disk-Creator funciona melhor quando executado na mesma versão do ISO que está sendo usado. Ele nem sequer cria com êxito um ISO inicializável para o Ubuntu 16.04 quando executado em um sistema 14.04, portanto, a falha no 12.04 não é surpresa. Os bugs nesse comportamento têm anos, adicione-se às listas "isso me afeta". Como você descobriu, dd é a solução alternativa comum e, com mídia perfeita, funciona bem.
Os problemas do Startup Disk Creator resultam do uso de alguns arquivos de um sistema em execução, em vez de apenas arquivos do ISO. Esses arquivos podem ser da versão errada e podem falhar. Outra questão é a aparente dependência de links de sistemas de arquivos, que estão no sistema de arquivos ISO9660, mas não podem ser usados em um sistema de arquivos FAT. Apenas copiar os arquivos do ISO (montado em loop) para o USB (sistema de arquivos FAT) perde o link "ubuntu" e resulta em uma referência de argumento do kernel para "/cdrom/preseed/..." que não existe. A remoção dessa referência no grub.cfg resultará em um USB inicializável UEFI.
O criador de mídia mkusb mais recente faz a cópia do dd, com mais recursos de segurança para garantir que você selecione o destino correto.