Instalei recentemente o Ubuntu Gnome 16.04, muito bom, multiboot com Mate-mint, windows e ocasionalmente hacintosh.
O que me incomoda é que quando ele me pede senha (gui) todas as outras coisas ficam inativas. Não é só em cima dos outros, não posso fazer mais nada. O Mate me permite fazer outras atividades, então clico no painel, no script que fiz, preencho automaticamente o texto da senha, ao mesmo tempo.
É possível fazer a mesma coisa com o GNOME?
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Se você não se importa com a consistência da GUI, os agentes polkit de diferentes ambientes de desktop podem substituir uns aos outros.
Como você mencionou que a caixa de diálogo de posicionamento não tem modelo (não bloqueia o foco), você pode usá-la.
Desative a inicialização automática do agente gnome renomeando-o como arquivo de inicialização automática.
sudo mv /etc/xdg/autostart/polkit-gnome-authentication-agent-1.desktop /etc/xdg/autostart/polkit-gnome-authentication-agent-1.desktop.disabled
Edite o mate um para iniciar automaticamente com a sessão do gnome também ao lado do mate.
~$ sudo nano /etc/xdg/autostart/polkit-mate-authentication-agent-1.desktop ... OnlyShowIn=MATE;GNOME; X-MATE-AutoRestart=true X-GNOME-AutoRestart=true