Após a atualização do Ubuntu Gnome 14.04 para 16.04, a maioria das barras de título da janela do aplicativo padrão aparecem quebradas (parecendo muito grandes). Usei o procedimento de atualização da GUI (não do terminal). Aplicativo padrão significa navegador de arquivos, calculadora, janela de configuração, etc. Observação:Durante a atualização, ele me perguntou se deveria substituir o arquivo de configuração ou manter o mais antigo, optei por manter o mais antigo.
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O problema ocorreu devido a alguma incompatibilidade de ícones. Eu estava usando o 'Fs-icons-ubuntu-megypt' que não era compatível com o Ubuntu 16.04. Na ferramenta de ajuste, mudei os ícones para o padrão e o problema foi resolvido.