Faz muito tempo que não preciso mexer no X (acho que ainda era quando o Xfree86 governava). Algumas semanas atrás, no entanto, eu estava tentando fazer com que um laptop usasse um monitor externo e consegui prejudicar a configuração (tela piscando irritante).
Como o laptop já estava precisando de uma atualização (e eu tinha um backup de /home), acabei de atualizar para F24 e segui em frente, mas isso me fez pensar que provavelmente deveria ter um backup de uma configuração funcional.
Quais arquivos devo fazer backup caso precise mexer no X novamente?
Ou devo apenas fazer backup de tudo /etce não me preocupar com detalhes?
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Apenas faça backup /etc. (E não coloque arquivos de configuração em outro lugar, obviamente, por exemplo, nunca modifique arquivos em /usr.)
Em vez de criar o seu próprio, instaleetckeeper, que confirma automaticamente as modificações no sistema de controle de versão escolhido nas atualizações de pacotes. Ao fazer alterações, confirme-as ( git commitou hg commitou bzr commitou darcs record) com uma mensagem de log explícita para lembrar por que você fez isso.