Usarei o comando "do-release-upgrade" para passar de 12.04 para 14.04. Eu preferiria não me envolver na atualização ou reinstalação de serviços. O Apache2 e o MySQL continuarão funcionando após a atualização?
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Em geral, funcionará e se o processo de atualização funcionar, tudo dará certo. Se houver uma queda de energia, você terá problemas...
Você pode planejar falhas na atualização. Tal como acontece com TODAS as atualizações:
Eu presumo que você descartaria seu banco de dados e criaria uma cópia de my.cnf. Isso é tudo para o MySQL. Se não funcionar após a atualização, provavelmente é uma configuração que precisa de ajustes.
O mesmo para o Apache: presumo que você crie um backup de suas configurações (/etc/apache2/) e de seus sites (pode ser /var/www/) e outras configurações. Copiar o arquivo de configurações antigo sobre o novo geralmente funciona quando faço isso.