Как использовать grep с шаблонами в файле и получить количество вхождений каждого шаблона?

Question

Я пытаюсь выяснить, как использовать grep с шаблонами в fileA.txt и искать их в fileB.tab. Результат, который я хочу получить, — это количество вхождений каждого шаблона в fileB.tab.

Я пытался:

grep -f FileA.txt FileB.tab | wc -l

Но я думаю, что это возвращает мне все строки в FileB.tab, где появляется шаблон fileA.tab.

Answer 1

Если patternsфайл содержит только фиксированные строки, при gnuнастройке вы можете сделать следующее:

grep -oFf patterns infile | sort | uniq -c

Если содержимое — это регулярное выражение, то может быть что-то вроде

sed -E 'h;s|/|\\&|g;x;s|[\&/]|\\&|g;H;x;s|(.*)\n(.*)|s/\1/\2/|' patterns \
| sed -f - <(grep -of patterns infile)  | sort | uniq -c

то есть использовать ту же grepкоманду, только на этот раз обработать результат так, sedчтобы заменить совпадения фактическим шаблоном (с помощью другого sedскрипта, основанного на содержимом patterns)

Answer 2

uniq имеет возможность подсчитывать вхождения

grep -f fileA.txt fileB.txt | uniq -c

Однако имейте в виду, что если в вашем fileA есть дубликаты, подсчет будет неверным, так как grep будет выполняться несколько раз. В этом случае сначала пропустите fileA через uniq, чтобы удалить дубликаты, а затем используйте его для шаблонов.

Вы можете отфильтровать его в новый файл или обработать файл построчно и запустить его оттуда.

while read keyword; do grep $keyword fileB.txt; done < fileA.txt | uniq -c