Я пытался запустить NGS QC Toolkit http://59.163.192.90:8080/ngsqctoolkit/
в версии Ubuntu 12.04 LTS 64 бит. Но после выполнения команды появляется ошибка, сообщающая о том, что модуль не может быть найден String::Approx
и его необходимо установить, хотя я успешно его установил.
Вот команда, которую я использовал:
perl ~/Programs/NGSQCToolkit_v2.3/QC/IlluQC_PRLL.pl -c 2 -pe /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_1.fastq /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_2.fastq 2
A Error:
Can not find module 'String::Approx'
Install it and try again
Пожалуйста, помогите мне решить эту проблему.
решение1
Выполните следующие команды:
shrujan@ubuntu:~$ cpan
cpan[1] install String::Approx
Тогда попробуйте ваш NGSQCTool