В моей лаборатории работает кластер Ubuntu, и в целом я взаимодействую с ним на моем личном Macbook с помощью SSH. Недавно я вышел за рамки командной строки и экспериментировал с получением графической функциональности с помощью X11. Большинство вещей прекрасно работают через команды SSH -X или -Y, но некоторые вещи определенно не работают.
В частности, PyMol, который является визуализатором молекулярных структур, вообще не работает. Когда я пытаюсь загрузить его с помощью
ssh -X кластер pymol
или
ssh -Y кластер пимол
Я получаю следующую ошибку:
Предупреждение: Нет данных xauth; используются поддельные данные аутентификации для пересылки X11.
Xlib: расширение "Generic Event Extension" отсутствует на дисплее "localhost:11.0".
freeglut (pymol): ОШИБКА: Внутренняя ошибка "Visual with necessary capabilities not found" в функции fgOpenWindowPyMOL: внезапное завершение работы программы.
X Ошибка неудавшегося запроса: BadWindow (недопустимый параметр окна)
Основной код операции неудавшегося запроса: 4 (X_DestroyWindow)
Идентификатор ресурса в неудавшемся запросе: 0x0
Серийный номер неудавшегося запроса: 19
Текущий серийный номер в выходном потоке: 22
Macbook немного староват и использует для графики GMA 950. Что вызывает указанную выше ошибку, и можно ли что-то с этим сделать?
решение1
Существует ли в системе «glxgears» и работает ли он по ssh?
У меня была похожая проблема, решил я ее так:
glxgears # crash
sudo apt-get install mesa-utils
LIBGL_ALWAYS_INDIRECT=1 glxgears # works
Добавьте это в .bash_profile:
export LIBGL_ALWAYS_INDIRECT=1