☰

Какой самый простой способ объединить группы файлов?

tag-icon • tag-icon bash-scripting
Какой самый простой способ объединить группы файлов?

У меня есть файлы с именами по этому шаблону:

bond_7.LEU.CA.1.dat
bond_7.LEU.CA.2.dat
bond_7.LEU.CA.3.dat
bond_12.ALA.CB.1.dat
bond_12.ALA.CB.2.dat
bond_12.ALA.CB.3.dat
...

Я хочу объединить все файлы одной группы в один. Например:

cat bond_7.LEU.CA.*.dat > ../bondvalues/bond_7.LEU.CA.1_3.dat

Таких файлов очень много. Как этого добиться с помощью скрипта bash?

решение1

Если предположить, что приведенный вами пример отражает все ваши файлы, то следующее должно сработать:

for f in *.1.dat
do
  cat ${f%%1.dat}* > ${f%%1.dat}1_3.dat
done

Для этого необходимо, чтобы каждая группа содержала файл с расширением .1.dat.

решение2

printf "%s\n" * | cut -d. -f1-3 | sort -u | while read prefix; do
  files=(${prefix}*)
  first=$(cut -d. -f4 <<< "${files[0]}")
  last=$(cut -d. -f4 <<< "${files[${#files[@]}-1]}")
  newfile=$(printf "../bondvalues/%s.%s_%s.dat" "$prefix" "$first" "$last")
  cat "${files[@]}" > "$newfile"
done

Связанный контент