☰

Найти Поиск Заменить от ориентира к ориентиру - включая все, что между ними

tag-icon • tag-icon notepad++
Найти Поиск Заменить от ориентира к ориентиру - включая все, что между ними

У меня есть следующая строка

>gi|374638939|gb|AEZ55452.1| myosin light chain 2, partial [Batrachoseps major]
AAMGR

Спорадически повторяется по всему документу, и я хочу удалить все, начиная >gi|37463с последовательности `AAMGR

Но я хочу сохранить блоки, где JQ250появляется:

>gi|374638936|gb|**JQ250**332.1| Batrachoseps major isolate b voucher DBW5974 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCNGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCATGCAATGGGGGCGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACCTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
TCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTCC
CAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

И удалите только те строки, которые имеютAEZ554

>gi|374638939|gb|**AEZ554**52.1| myosin light chain 2, partial [Batrachoseps major]
AAMGR

Итак, в идеале следующий блок:

>gi|374638934|gb|JQ250331.1| Batrachoseps major isolate a voucher DBW5974 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCNGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCATGCAATGGGGGCGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACCTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
TCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTCC
CAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

>gi|374638935|gb|AEZ55450.1| myosin light chain 2, partial [Batrachoseps major]
AAMGR

>gi|374638936|gb|JQ250332.1| Batrachoseps major isolate b voucher DBW5974 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCNGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCATGCAATGGGGGCGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACCTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
TCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTCC
CAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

>gi|374638937|gb|AEZ55451.1| myosin light chain 2, partial [Batrachoseps major]
AAMGR

>gi|374638938|gb|JQ250333.1| Batrachoseps major isolate a voucher MVZ:Herp:249023 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCCGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCCTGCAATGGGGGTGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACTTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
CCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTC
CCAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

>gi|374638939|gb|AEZ55452.1| myosin light chain 2, partial [Batrachoseps major]
AAMGR

Осталось бы просто

>gi|374638934|gb|JQ250331.1| Batrachoseps major isolate a voucher DBW5974 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCNGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCATGCAATGGGGGCGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACCTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
TCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTCC
CAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

>gi|374638936|gb|JQ250332.1| Batrachoseps major isolate b voucher DBW5974 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCNGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCATGCAATGGGGGCGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACCTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
TCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTCC
CAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

>gi|374638938|gb|JQ250333.1| Batrachoseps major isolate a voucher MVZ:Herp:249023 myosin light chain 2 gene, partial cds
GCCGCCATGGGTAAGTGAACGCGCCGGACCAGACCATTCACTGCCTGCAATGGGGGTGTTTGTGGGTTGG
AAGGTGTGCCAAAGATCTAGGGAACCCCAACTCCTCAGGATACGGGTGGGAGCCCTAAAATATGTCCAGC
TATAAGGAGATGACCAATGGAAAAGGGGGTATCAGCAGTACTTTACTTGCTACTATAAGAGAATTGCATC
CTGGGAATAGCCTCTGAAAGGTCCCATTTTAGCGACACTGGTAGATGGACACTGGCCTTTGGACAGCACC
AGTAAGTAGAGCATTGCATCTTGGGATTCCTTTGCTGTTCACATGCCACTGAAAGCTCTCACCATAGCAG
ATTCAAAATGCCTACCCGGCAGGTTGCCAGAAAAGCACTGCATCATGGGAGAACCACTTTTAGTGACAAT
CCTAAGAGATGGGTGTCTCTCTGCCAGGCGCTATTATCCAAGAGACCCCAGTATGACGTCGTCATTGCTC
CCAGGTAACCATGTTCTCACCCCCTCTCCCACAGGCCGC

решение1

Первый шаг: убедитесь, что вы используете последнюю версию Notepad++ (должно работать на версии 6 или выше, протестировано на версии 6.1.8) — спасибоБобдля этого. Вы можете использовать режим «Регулярное выражение» диалогового окна поиска и замены в Notepad++, чтобы удалить текст между двумя маркерами.

Чтобы найти все строки, которые начинаются с >gi|37463и заканчиваются на AAMGR, введите это в поле «Найти:» >gi\|37463.*AAMGR(\r\n)?, оставьте поле «Заменить на:» пустым, установите режим внизу на «Регулярное выражение» и убедитесь, что «. соответствует новой строке»неотмеченный.

Чтобы найти только строки, содержащие AEZ554в них, используйте эту строку поиска >gi\|37463.*AEZ554.*AAMGR(\r\n)?

Чтобы соответствовать всему этомуне содержат JQ250в них используйте эту строку поиска>gi\|37463(?!.*JQ250).*AAMGR(\r\n)?

Примечание:возможно, придется просто использовать \nвместо \r\n, если файл был создан в unix / linux.

Заметка 2:если вы хотите оставить пустую строку в файле, а не полностью удалять ее, удалите (\r\n)?из поискового запроса.

Заметка 3:Если бы вопрос был «Как удалить строки, содержащие , AEZ554из текстового файла?», то следующие команды оболочки сработали бы (и были бы быстрее):

в Windows XP:type oldfile.txt | find /I /V "AEZ55" > newfile.txt

в Linux/Windows 7:grep -v "AEZ55" oldfile.txt > newfile.txt

Аналогично, «Как удалить строки, которые не содержатся JQ250в текстовом файле?»

type oldfile.txt | find /I "JQ250" > newfile.txt

grep "JQ250" oldfile.txt > newfile.txt

Связанный контент