Я хотел бы установить PyMOL на свой ПК. Я удалил его вчера, потому что ранее я установил Python 2.7.9 через Python(x,y), в то время как моя установка PyMOL (которую я установил несколько месяцев назад, так что, боюсь, я забыл, как я это сделал) использовала Python 2.7.8, и в результате PyMOL больше не работал должным образом, например, посмотрите на этот снимок экрана, который я сделал, GUI-средство просмотра молекул не было видно, только консоль.
Я пробовал использовать файлы колес (а именноhttp://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymolamd64 версия), но я столкнулся с проблемами pip. Посмотрите на pip, который я получил вместе с моей 64-битной установкой Python 2.7.9, и exe-файл для pip называется pip2.exe. Поэтому я изменил системную переменную среды PYTHONPATH
на C:\Python27
(где находится установка python) и PATH
на C:\Python27\Scripts
which is where pip2.exe
is (вместе с pip2.7.exe, easy_install.exe и easy_install-2.7.exe, если это уместно). Затем я запустил:
pip2 install pymol-1.7.2.1-cp27-none-win_amd64.whl
из командной строки, но это дало ошибку:
Traceback (most recent call last):
File "C:\Python27\lib\runpy.py", line 162, in _run_module_as_main
"__main__", fname, loader, pkg_name)
File "C:\Python27\lib\runpy.py", line 72, in _run_code
exec code in run_globals
File "C:\Python27\Scripts\pip2.exe\__main__.py", line 5, in <module>
ImportError: No module named pip
Редактировать: #1
Я удалил Python и переустановил его (снова 64-битную версию), так как подозревал, что в моей предыдущей установке произошли какие-то ошибки (на этот раз pip, который поставлялся с ним, включал файл pip.exe в папке Scripts), затем я снова запустил команду установки Pymol (после запуска pip install wheel-0.24.0-py2.py3-none-any.whl
, загруженного с , с этим файлом, загруженным сhttps://pypi.python.org/packages/py2.py3/w/wheel/wheel-0.24.0-py2.py3-none-any.whl#md5=4c24453cda2177fd42c5d62d6434679a) и получил другую ошибку, файл pip.log можно найти здесь:http://goo.gl/ORVNPB.
Еще одна попытка
Затем я скачалhttps://codeload.github.com/evonove/pymol/zip/1.7.4, извлек его содержимое и запустил
python setup.py сборка установка
Это дало результат:
running build
running build_py
running build_ext
building 'pymol._cmd' extension
Traceback (most recent call last):
File "setup.py", line 349, in <module>
data_files = data_files
File "C:\Python27\lib\distutils\core.py", line 151, in setup
dist.run_commands()
File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 953, in run_commands
self.run_command(cmd)
File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 972, in run_command
cmd_obj.run()
File "C:\Python27\lib\distutils\command\build.py", line 127, in run
self.run_command(cmd_name)
File "C:\Python27\lib\distutils\cmd.py", line 326, in run_command
self.distribution.run_command(command)
File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 972, in run_command
cmd_obj.run()
File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 337, in run
self.build_extensions()
File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 446, in build_exte
nsions
self.build_extension(ext)
File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 496, in build_exte
nsion
depends=ext.depends)
File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 473, in compile
self.initialize()
File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 383, in initialize
vc_env = query_vcvarsall(VERSION, plat_spec)
File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 299, in query_vcvarsal
l
raise ValueError(str(list(result.keys())))
ValueError: [u'path']