Я использовал XMedia Recode, чтобы сделать это, и он отлично работает. Я установил видео на «копировать», аудио на «конвертировать», и это заняло 2 минуты для файла размером 2 ГБ. Однако есть две проблемы с пакетной обработкой. Он не обнаруживает файлы в подпапках, и вам нужно указать битрейт аудио.
Я хотел бы иметь возможность, например, конвертировать все в Z:\Videos, наследовать битрейт аудио и поместить файл с именем "(исходный файл)-converted" в исходную папку. Это возможно, может быть, с помощью ffmpeg? Работает в Windows 8.1.