Как заменить пробел на __

Question

У меня есть файл, содержащий пробел, например, такой:

ACTTTTTTTTGSGSGSGSG  TTT
RTATATTATRSSTSTSTST  HHH

Я хочу убрать пробел и получить результат:

ACTTTTTTTTGSGSGSGSG__TTT
RTATATTATRSSTSTSTST__HHH

Answer 1

С sed, предполагая, что цель состоит в замене каждого пробела на подчеркивание ( _), для всех пробелов в строках

sed 's/ /_/g' file

Тесты

$ cat file
ACTTTTTTTTGSGSGSGSG  TTT
RTATATTATRSSTSTSTST  HHH

$ sed 's/ /_/g' file
ACTTTTTTTTGSGSGSGSG__TTT
RTATATTATRSSTSTSTST__HHH

Answer 2

Добавляя к ответу @Paulo Tomé, предположим, что может бытьболеечем два пробела:

tr -s '[[:blank:]]' < file | sed 's/[[:blank:]]/__/'

Предположим, что всегда два пробела:

tr '[[:blank:]]' '_' < file 

Это работает, даже если пробелы являются символами табуляции: