Как заменить совпадающую строку в одном файле на совпадающую строку в другом файле?

Question

У меня есть такой файл:

head cleandata.map
1   1:775852:T:C    0   775852
1   1:1120590:A:C   0   1120590
1   1:1145994:T:C   0   1145994
1   1:1148494:A:G   0   1148494
...

И еще один файл:

head lifted.map
1   1:775852:T:C    0.0 785989
1   1:1120590:A:C   0.0 1130727
1   1:1145994:T:C   0.0 1156131
1   1:1148494:A:G   0.0 1158631
...

Я хочу получить измененный cleandata.map, который будет выглядеть следующим образом:

1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631
...

Таким образом, если строка во 2-м столбце lifted.map совпадает со строкой во 2-м столбце cleandata.map, замените строку во 2-м и 4-м столбцах cleandata.map значением 4-го столбца в lifted.map.

Answer 1

Пытаться

$ awk 'FNR==NR {T[$2] = $4; next} $2 in T {gsub ($4, T[$2])} 1' file2 file1
1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631