У меня много файлов (с .fna
расширением). Мне нужно переместить их, если они содержат символ>определенное количество раз.
Я знаю, какие файлы содержат>определенное количество раз (в данном примере 9 раз) с помощью этой команды.
grep -c ">" *.fna | grep ":9"
Что дает такой вывод
5242_ref.fna:9
9418_ref.fna:9
Но я не знаю, как переместить эти файлы в другую папку.
Спасибо.
решение1
Объединив egrep
(вызывается с -l
опцией, чтобы положительные совпадения возвращали только имена файлов) сxargs
Вы можете выполнять произвольные команды на основе текстовых соответствий:
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls
destination example.fna non_example.fna
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ cat example.fna
>>>>>>>>>
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ cat non_example.fna
<<<<<<<<<
>>
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ egrep -l '>{9}' *.fna | xargs -I{} mv {} destination/
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls
destination non_example.fna
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls destination/
example.fna
Редактировать: Это не соответствует файлам с определенным количеством экземпляров символа, если они разделены другими символами или символами новой строки. Я создал этот короткий скрипт, который должен работать так, как нужно.
#! /usr/bin/env bash
DESTINATION=./destination
MATCH_CHAR='>'
MATCH_COUNT=9
for FILE in $1; do
MATCHES=$(grep -o $MATCH_CHAR $FILE | wc -l)
if [ $MATCHES -eq $MATCH_COUNT ]; then
mv $FILE $DESTINATION
fi
done
Пример:
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls
destination example.fna mver non_example.fna
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ cat example.fna
>>
>>foo>>bar>>>baz
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ cat non_example.fna
<<<<<<<<<
>>
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ./mver *.fna
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls destination/
example.fna
[gnubeard@mothership: ~/mver]$ ls
destination mver non_example.fna
решение2
Вы можете использовать zsh с еговыражение-как-квалификатор-глобачтобы выбрать файлы, содержащие только девять таких символов:
$ hasnine() { [[ $(tr -dc '>' < "$REPLY" | wc -c) -eq 9 ]]; }
$ mv *.fna(+hasnine) location/
Первая строка определяет функцию, целью которой является создание фильтра true/false для файлов, содержащих девять >
символов. tr
Команда действует на свой ввод, ожидаемый в REPLY
переменной, удаляя все, что не является >
, затем просит wc
подсчитать количество полученных символов, а затем сравнивает этот вывод с 9.
Вторая строка выполняет mv
команду для сопоставления файлов *.fna с location
каталогом (example). Сопоставленные файлы *.fna также должны передавать квалификатор выражения, который задается как имя функции, которую мы определили.