Bash-скрипт для чтения нескольких файлов

Question

Мне нужно прочитать несколько скриптов R (до 3, т.е. tr1.R, tr2.R, tr3.R).
Ниже приведен скрипт bash для чтения одного скрипта.

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00
#PBS -M 
#PBS -m e
module load R/4.0
Rscript ~/tr1.R

Я попробовал следующее, как предложил@кас

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00
#PBS -M 
#PBS -m e
module load R/4.0
**Rscript ~/tr"$i".R**

Далее работа отправляется с использованием

for i in {1..3} ; do
  qsub -o "default.$i.out" -e "errorfile$i" -v i script.sh
done

Это не удалось прочитатьRscript ~/tr"$i".R.

Answer 1

Это быстро и грязно:

#!/bin/bash

echo -e "Printing script.......\n"

y=0
for (( y=0; y <= 9; y++ ))
do
   echo "file tr$y.R contents: "
   cat tr$y.R
   echo ""   
done

Answer 2

А как насчет решения этой задачи на языке R следующим образом:

комбинированный.R:

source (tr1.R)
source (tr2.R)
source (tr3.R)

или вот так.

комбинированный.R:

for (i in c(1:9)) {
    filename <- paste ("tr", i, ".R", sep="")
    if (file.exists (filename)) {
        source (filename)
    }
}

И затем вы можете загрузить combined.R:

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00
#PBS -M 
#PBS -m e
module load R/4.0
Rscript ~/combined.R

---

О, теперь я вижу, что вы хотите запускать задания параллельно. Решение, которое я опубликовал, не запускает задания параллельно, но я оставлю ответ здесь. Может быть, кто-то найдет его полезным. Может быть, вы можете применить что-то вроде этогоhttps://www.blasbenito.com/post/02_parallelizing_loops_with_r/или этоhttps://stackoverflow.com/questions/38318139/запустить-a-for-loop-in-parallel-in-r.