☰

Perl-Минимальное и максимальное значение

tag-icon • tag-icon perl
Perl-Минимальное и максимальное значение

входной файл

Xm_ABL1 Geneious    extracted region    1   168 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3512970000000 -> 3514640000000"
Xm_ABL1 Geneious    extracted region    169 334 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3717850000000 -> 3719500000000"

часть кода perl

 if ($array[1] =~ /extracted region/){
            die "No CDS record for $key!\n" unless $metadata->{$key};
    (my $label = $array[7]) =~ s/.*region from (.*)\|;.*/$1/;
    $label =~ s/\|/_/g;
    $group->{$label} ||= { 
            pos1 => 1e10,
            pos2 => 0,
            metadata => $metadata->{$key},
            sequences => [],
    };
    (my $pos1, my $arr, my $pos2) = ($array[7]=~/.*interval=\"(\d+) (<?->?) (\d+)\"$/gm);
    # capture hi/lo values for group
    $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if $pos1 < $group->{$label}->{pos1};
    $group->{$label}->{pos2} = $pos2 if $pos2 > $group->{$label}->{pos2};
    # push this sequence onto the group's array
    push(@{ $group->{$label}->{sequences} }, [ $pos1, $pos2, $arrow->{$arr} ]);
}

В коде $pos1=3512970000000,3717850000000 & $pos2=3514640000000,3719500000000. Мой код печатает новую строку, находя минимальное и максимальное значение (если $pos1 меньше 10 000), но если значение больше 10 0000, он выдает ошибку при печати минимального значения pos1. Любая помощь в отладке для нахождения минимального значения $pos1 и максимального значения $pos2 приветствуется

решение1

$group->{$label}->{pos1}всегда определен, вы инициализировали его строкой 6:

pos1 => 1e10,

так что это работает до тех пор, пока $pos1 <= 1e10. Если вы хотите вывести минимальное значение $group->{$label}->{pos1} = 3512970000000(как в вашем примере ввода), вы должны инициализировать $group->{$label}->{pos1} = -1(строка 6):

pos1 => -1,

и измените строку 13 следующим образом:

$group->{$label}->{pos1} = $pos1 if (($group->{$label}->{pos1} < 0) || ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

решение2

изменив код в строке 13: используя defiend

 $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if ((!defined $group->{$label}->{pos1})
 ||  ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

Связанный контент