Я сразу заявляю, что я не совсем уверен, подходит ли этот вопрос большеПерекрестная проверкаили для этого сайта. Однако, поскольку я видел несколько вопросов о latex()
команде отсюда Hmisc
, я думаю, что этот вопрос подходит для этого сайта.
Я относительно опытный R
пользователь, но довольно новичок в LaTeX
. Я пытаюсь автоматически создать большое количество pdf-файлов из набора результатов, сгенерированных в R
. Я бы предпочел создать эти файлы полностью в R
, если это возможно. После некоторых поисков я решил сделать это с помощью комбинацииtables
пакет и latex()
функция изHmisc
.
Некоторые из создаваемых мной таблиц довольно большие, и поэтому, когда я просматриваю созданные мной pdf-файлы, таблицы, как правило, выходят за пределы страницы. Я бы хотел использовать либо команду , latex()
либо tabular()
команду внутри, R
чтобы уменьшить размер таблиц, которые появляются в моих результирующих pdf-файлах. latex
У функции есть аргумент " size
", но указание , size = "small"
похоже, не работает с таблицами, созданными вызовами tabular()
. Есть ли у кого-нибудь совет?
Пример кода можно найти ниже.
require(tables)
require(Hmisc)
# Create sample data
Condition <- factor(rep(c("Control", "Experimental"), 150))
Time <- factor(rep(c("Baseline", "Baseline", "Three days", "Three days",
"Three weeks", "Three weeks"), 50))
var1 <- rnorm(300)
var2 <- rnorm(300)
var3 <- rnorm(300)
var4 <- rnorm(300)
var5 <- rnorm(300)
var6 <- rnorm(300)
# Add to data frame, sprinkle in missing values
d <- data.frame(Condition, Time, var1, var2, var3, var4, var5, var6)
d[sample(1:300, 30), c("var1", "var2", "var3", "var4")] <- NA
d[sample(1:300, 20), c("var5", "var6")] <- NA
# Create helper functions
mean.narm <- function(x) mean(x, na.rm = TRUE)
sd.narm <- function(x) sd(x, na.rm = TRUE)
count.obs <- function(x) sum(!is.na(x))
# Use tabular() from tables
tab <- tabular((Heading("Variable 1") * var1 + Heading("Variable 2") * var2 +
Heading("Variable 3") * var3 + Heading("Variable 4") * var4 + Heading("Variable 5") * var5 +
Heading("Variable 6") * var6) * Time ~ Condition * ((N=count.obs) + (Mean=mean.narm) + (SD=sd.narm)),
data = d)
# Ensure that pdflatex is used when I call latex(), below
options(latexcmd = "pdflatex")
options(dviExtension = "pdf")
options(xdvicmd = "C:/PROGRA~1/R/R-215~1.3/bin/i386/open.exe")
# Use the latex() function
latex(tab, "table1.tex")
Редактировать: Как и просили, ниже приведен код, полученный из вызова latex(tab, "")
. Как я уже упоминал выше, я хочу не просто вручную изменить LaTeX, созданный функцией latex()
, но и гарантировать, что код LaTeX, созданный из вызова , latex()
создаст меньшую таблицу.
\begin{tabular}{llcccccc}
\hline
& & \multicolumn{6}{c}{Condition} \\
& & \multicolumn{3}{c}{Control} & \multicolumn{3}{c}{Experimental} \\
& Time & N & Mean & SD & N & Mean & \multicolumn{1}{c}{SD} \\
\hline
Variable 1 & Baseline & $42$ & $\phantom{-}0.029831$ & $1.0657$ & $46$ & $\phantom{-}0.0067612$ & $1.0687$ \\
& Three days & $44$ & $\phantom{-}0.109871$ & $1.0161$ & $43$ & $-0.1633312$ & $1.1552$ \\
& Three weeks & $47$ & $\phantom{-}0.160282$ & $1.0613$ & $48$ & $\phantom{-}0.1055877$ & $0.9537$ \\
Variable 2 & Baseline & $42$ & $-0.166005$ & $1.1078$ & $46$ & $\phantom{-}0.0012202$ & $0.9659$ \\
& Three days & $44$ & $-0.205125$ & $0.9315$ & $43$ & $-0.2294237$ & $1.0693$ \\
& Three weeks & $47$ & $-0.164718$ & $1.0122$ & $48$ & $-0.0769583$ & $1.0418$ \\
Variable 3 & Baseline & $42$ & $\phantom{-}0.077019$ & $1.0643$ & $46$ & $\phantom{-}0.0798812$ & $1.0396$ \\
& Three days & $44$ & $-0.282688$ & $0.9023$ & $43$ & $\phantom{-}0.1299074$ & $0.9916$ \\
& Three weeks & $47$ & $-0.291495$ & $1.0138$ & $48$ & $-0.0240293$ & $1.0309$ \\
Variable 4 & Baseline & $42$ & $-0.247300$ & $1.0963$ & $46$ & $-0.0409480$ & $1.0901$ \\
& Three days & $44$ & $-0.158524$ & $1.0995$ & $43$ & $\phantom{-}0.1486800$ & $0.8722$ \\
& Three weeks & $47$ & $-0.149038$ & $0.8798$ & $48$ & $-0.0002842$ & $0.9750$ \\
Variable 5 & Baseline & $49$ & $\phantom{-}0.008081$ & $0.8102$ & $47$ & $-0.3131353$ & $1.0592$ \\
& Three days & $45$ & $-0.241864$ & $1.0037$ & $45$ & $\phantom{-}0.1130470$ & $0.8106$ \\
& Three weeks & $44$ & $-0.177473$ & $1.0706$ & $50$ & $-0.0264635$ & $0.7805$ \\
Variable 6 & Baseline & $49$ & $\phantom{-}0.013659$ & $1.0833$ & $47$ & $-0.0967571$ & $1.0676$ \\
& Three days & $45$ & $\phantom{-}0.098045$ & $0.9842$ & $45$ & $\phantom{-}0.0756736$ & $0.9613$ \\
& Three weeks & $44$ & $-0.152400$ & $1.0654$ & $50$ & $-0.2145893$ & $1.0157$ \\
\hline
\end{tabular}
решение1
Поскольку вы используете tables
пакет R
, вы должны использовать Sweave
. Вот .Rnw
файл, который может вам подойти. У меня не так много опыта работы с R
. Я просто использую его для некоторых базовых статистических вычислений. Поэтому извините, если я не могу дать вам точного ответа, можно ли настроить размер таблицы с помощью команды latex()
. Если бы это был ваш единственный вариант, я бы предложил спросить вПерекрестная проверка.
Сохраните это как foobar.Rnw
и поместите в ваш рабочий каталог. Теперь в R установите ваш рабочий каталог с помощью setwd()
(если вы еще этого не сделали). Теперь запустите
Sweave("foobar.Rnw")
Если вам это удастся, вы увидите
You can now run (pdf)latex on ‘tableprosweave.tex’
в конце.
Теперь в вашем рабочем каталоге откройте foobar.tex
ваш любимый редактор TeX и запустите pdflatex
или просто запустите
pdflatex foobar
в терминале/командной строке.
foobar.Rnw
:
\documentclass{article}
\usepackage{Sweave}
\usepackage{booktabs}
\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE, keep.source=TRUE}
<<echo=false>>=
options(width=60)
@
<<>>=
require(tables)
require(Hmisc)
booktabs() % To use booktabs formatting
# Create sample data
Condition <- factor(rep(c("Control", "Experimental"), 150))
Time <- factor(rep(c("Baseline", "Baseline", "Three days", "Three days",
"Three weeks", "Three weeks"), 50))
var1 <- rnorm(300)
var2 <- rnorm(300)
var3 <- rnorm(300)
var4 <- rnorm(300)
var5 <- rnorm(300)
var6 <- rnorm(300)
# Add to data frame, sprinkle in missing values
d <- data.frame(Condition, Time, var1, var2, var3, var4, var5, var6)
d[sample(1:300, 30), c("var1", "var2", "var3", "var4")] <- NA
d[sample(1:300, 20), c("var5", "var6")] <- NA
# Create helper functions
mean.narm <- function(x) mean(x, na.rm = TRUE)
sd.narm <- function(x) sd(x, na.rm = TRUE)
count.obs <- function(x) sum(!is.na(x))
# Use tabular() from tables
tab <- tabular((Heading("Variable 1") * var1 + Heading("Variable 2") * var2 +
Heading("Variable 3") * var3 + Heading("Variable 4") * var4 + Heading("Variable 5") * var5 +
Heading("Variable 6") * var6) * Time ~ Condition * ((N=count.obs) + (Mean=mean.narm) + (SD=sd.narm)),
data = d)
@
\newpage
% Here, \small was written just before the code chunk.
\begin{center}
\small
<<results=tex,echo=FALSE>>=
latex(
tab
)
@
\end{center}
\vfill
% Here, \scriptsize was written just before the code chunk.
\begin{center}
\scriptsize
<<results=tex,echo=FALSE>>=
latex(
tab
)
@
\end{center}
%<<>>=
%# Ensure that pdflatex is used when I call latex(), below
%options(latexcmd = "pdflatex")
%options(dviExtension = "pdf")
%options(xdvicmd = "C:/PROGRA~1/R/R-215~1.3/bin/i386/open.exe")
%# Use the latex() function
%#latex(tab, file="table1.tex")
%@
\end{document}
Я закомментировал последние строки, так как на самом деле не знаю, что они делают, а также для того, чтобы файл можно было скомпилировать на моем компьютере. :-)
Вот вывод второй страницы.
Если вы действительно хотите получить только табличный вывод, я предлагаю вам просто написать \small
или \footnotesize
и т. д. перед фрагментом кода. Опять же, я не знаю, как это сделать с помощью только функции latex()
. R
Смотритеmanual
для получения дополнительной информации о Sweave
.
Некоторые редакторы позволяют редактировать и компилировать .Rnw
непосредственно из исходного кода, напримерRstudio. НАСКОЛЬКО МНЕ ИЗВЕСТНО,Texmaker
также может справиться с этим.