Управление размером таблиц, создаваемых с помощью функций R tabular() и latex()

Управление размером таблиц, создаваемых с помощью функций R tabular() и latex()

Я сразу заявляю, что я не совсем уверен, подходит ли этот вопрос большеПерекрестная проверкаили для этого сайта. Однако, поскольку я видел несколько вопросов о latex()команде отсюда Hmisc, я думаю, что этот вопрос подходит для этого сайта.

Я относительно опытный Rпользователь, но довольно новичок в LaTeX. Я пытаюсь автоматически создать большое количество pdf-файлов из набора результатов, сгенерированных в R. Я бы предпочел создать эти файлы полностью в R, если это возможно. После некоторых поисков я решил сделать это с помощью комбинацииtablesпакет и latex()функция изHmisc.

Некоторые из создаваемых мной таблиц довольно большие, и поэтому, когда я просматриваю созданные мной pdf-файлы, таблицы, как правило, выходят за пределы страницы. Я бы хотел использовать либо команду , latex()либо tabular()команду внутри, Rчтобы уменьшить размер таблиц, которые появляются в моих результирующих pdf-файлах. latexУ функции есть аргумент " size", но указание , size = "small"похоже, не работает с таблицами, созданными вызовами tabular(). Есть ли у кого-нибудь совет?

Пример кода можно найти ниже.

require(tables)
require(Hmisc)

# Create sample data
Condition <- factor(rep(c("Control", "Experimental"), 150))
Time <- factor(rep(c("Baseline", "Baseline", "Three days", "Three days", 
   "Three weeks", "Three weeks"), 50))
var1 <- rnorm(300)
var2 <- rnorm(300)
var3 <- rnorm(300)
var4 <- rnorm(300)
var5 <- rnorm(300)
var6 <- rnorm(300)

# Add to data frame, sprinkle in missing values
d <- data.frame(Condition, Time, var1, var2, var3, var4, var5, var6)
d[sample(1:300, 30), c("var1", "var2", "var3", "var4")] <- NA
d[sample(1:300, 20), c("var5", "var6")] <- NA

# Create helper functions
mean.narm <- function(x) mean(x, na.rm = TRUE)
sd.narm <- function(x) sd(x, na.rm = TRUE)
count.obs <- function(x) sum(!is.na(x))
# Use tabular() from tables
tab <- tabular((Heading("Variable 1") * var1 + Heading("Variable 2") * var2 + 
   Heading("Variable 3") * var3 + Heading("Variable 4") * var4 + Heading("Variable 5") * var5 + 
   Heading("Variable 6") * var6) * Time ~ Condition * ((N=count.obs) + (Mean=mean.narm) + (SD=sd.narm)),
           data = d)

# Ensure that pdflatex is used when I call latex(), below
options(latexcmd = "pdflatex")
options(dviExtension = "pdf")
options(xdvicmd = "C:/PROGRA~1/R/R-215~1.3/bin/i386/open.exe")
# Use the latex() function
latex(tab, "table1.tex")

Редактировать: Как и просили, ниже приведен код, полученный из вызова latex(tab, ""). Как я уже упоминал выше, я хочу не просто вручную изменить LaTeX, созданный функцией latex(), но и гарантировать, что код LaTeX, созданный из вызова , latex()создаст меньшую таблицу.

\begin{tabular}{llcccccc}
\hline
& & \multicolumn{6}{c}{Condition} \\ 
& & \multicolumn{3}{c}{Control} & \multicolumn{3}{c}{Experimental} \\ 
 & Time & N & Mean & SD & N & Mean & \multicolumn{1}{c}{SD} \\ 
\hline
Variable 1 & Baseline  & $42$ & $\phantom{-}0.029831$ & $1.0657$ & $46$ & $\phantom{-}0.0067612$ & $1.0687$ \\
 & Three days  & $44$ & $\phantom{-}0.109871$ & $1.0161$ & $43$ & $-0.1633312$ & $1.1552$ \\
 & Three weeks  & $47$ & $\phantom{-}0.160282$ & $1.0613$ & $48$ & $\phantom{-}0.1055877$ & $0.9537$ \\
Variable 2 & Baseline  & $42$ & $-0.166005$ & $1.1078$ & $46$ & $\phantom{-}0.0012202$ & $0.9659$ \\
 & Three days  & $44$ & $-0.205125$ & $0.9315$ & $43$ & $-0.2294237$ & $1.0693$ \\
 & Three weeks  & $47$ & $-0.164718$ & $1.0122$ & $48$ & $-0.0769583$ & $1.0418$ \\
Variable 3 & Baseline  & $42$ & $\phantom{-}0.077019$ & $1.0643$ & $46$ & $\phantom{-}0.0798812$ & $1.0396$ \\
 & Three days  & $44$ & $-0.282688$ & $0.9023$ & $43$ & $\phantom{-}0.1299074$ & $0.9916$ \\
 & Three weeks  & $47$ & $-0.291495$ & $1.0138$ & $48$ & $-0.0240293$ & $1.0309$ \\
Variable 4 & Baseline  & $42$ & $-0.247300$ & $1.0963$ & $46$ & $-0.0409480$ & $1.0901$ \\
 & Three days  & $44$ & $-0.158524$ & $1.0995$ & $43$ & $\phantom{-}0.1486800$ & $0.8722$ \\
 & Three weeks  & $47$ & $-0.149038$ & $0.8798$ & $48$ & $-0.0002842$ & $0.9750$ \\
Variable 5 & Baseline  & $49$ & $\phantom{-}0.008081$ & $0.8102$ & $47$ & $-0.3131353$ & $1.0592$ \\
 & Three days  & $45$ & $-0.241864$ & $1.0037$ & $45$ & $\phantom{-}0.1130470$ & $0.8106$ \\
 & Three weeks  & $44$ & $-0.177473$ & $1.0706$ & $50$ & $-0.0264635$ & $0.7805$ \\
Variable 6 & Baseline  & $49$ & $\phantom{-}0.013659$ & $1.0833$ & $47$ & $-0.0967571$ & $1.0676$ \\
 & Three days  & $45$ & $\phantom{-}0.098045$ & $0.9842$ & $45$ & $\phantom{-}0.0756736$ & $0.9613$ \\
 & Three weeks  & $44$ & $-0.152400$ & $1.0654$ & $50$ & $-0.2145893$ & $1.0157$ \\
\hline 
\end{tabular}

решение1

Поскольку вы используете tablesпакет R, вы должны использовать Sweave. Вот .Rnwфайл, который может вам подойти. У меня не так много опыта работы с R. Я просто использую его для некоторых базовых статистических вычислений. Поэтому извините, если я не могу дать вам точного ответа, можно ли настроить размер таблицы с помощью команды latex(). Если бы это был ваш единственный вариант, я бы предложил спросить вПерекрестная проверка.

Сохраните это как foobar.Rnwи поместите в ваш рабочий каталог. Теперь в R установите ваш рабочий каталог с помощью setwd()(если вы еще этого не сделали). Теперь запустите

Sweave("foobar.Rnw")

Если вам это удастся, вы увидите

You can now run (pdf)latex on ‘tableprosweave.tex’

в конце.

Теперь в вашем рабочем каталоге откройте foobar.texваш любимый редактор TeX и запустите pdflatexили просто запустите

pdflatex foobar

в терминале/командной строке.

foobar.Rnw:

\documentclass{article}

\usepackage{Sweave}
\usepackage{booktabs}

\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE, keep.source=TRUE}
<<echo=false>>=
options(width=60)
@

<<>>=
require(tables)
require(Hmisc)

booktabs() % To use booktabs formatting

# Create sample data
Condition <- factor(rep(c("Control", "Experimental"), 150))
Time <- factor(rep(c("Baseline", "Baseline", "Three days", "Three days", 
   "Three weeks", "Three weeks"), 50))
var1 <- rnorm(300)
var2 <- rnorm(300)
var3 <- rnorm(300)
var4 <- rnorm(300)
var5 <- rnorm(300)
var6 <- rnorm(300)

# Add to data frame, sprinkle in missing values
d <- data.frame(Condition, Time, var1, var2, var3, var4, var5, var6)
d[sample(1:300, 30), c("var1", "var2", "var3", "var4")] <- NA
d[sample(1:300, 20), c("var5", "var6")] <- NA

# Create helper functions
mean.narm <- function(x) mean(x, na.rm = TRUE)
sd.narm <- function(x) sd(x, na.rm = TRUE)
count.obs <- function(x) sum(!is.na(x))
# Use tabular() from tables

tab <- tabular((Heading("Variable 1") * var1 + Heading("Variable 2") * var2 + 
   Heading("Variable 3") * var3 + Heading("Variable 4") * var4 + Heading("Variable 5") * var5 + 
   Heading("Variable 6") * var6) * Time ~ Condition * ((N=count.obs) + (Mean=mean.narm) + (SD=sd.narm)),
           data = d)
@

\newpage

% Here, \small was written just before the code chunk.

\begin{center}
\small
<<results=tex,echo=FALSE>>=
latex(
tab
)
@
\end{center}

\vfill

% Here, \scriptsize was written just before the code chunk.

\begin{center}
\scriptsize
<<results=tex,echo=FALSE>>=
latex(
tab
)
@
\end{center}

%<<>>=
%# Ensure that pdflatex is used when I call latex(), below
%options(latexcmd = "pdflatex")
%options(dviExtension = "pdf")
%options(xdvicmd = "C:/PROGRA~1/R/R-215~1.3/bin/i386/open.exe")
%# Use the latex() function
%#latex(tab, file="table1.tex")
%@

\end{document}

Я закомментировал последние строки, так как на самом деле не знаю, что они делают, а также для того, чтобы файл можно было скомпилировать на моем компьютере. :-)Вот вывод второй страницы.

введите описание изображения здесь

Если вы действительно хотите получить только табличный вывод, я предлагаю вам просто написать \smallили \footnotesizeи т. д. перед фрагментом кода. Опять же, я не знаю, как это сделать с помощью только функции latex(). RСмотритеmanualдля получения дополнительной информации о Sweave.

Некоторые редакторы позволяют редактировать и компилировать .Rnwнепосредственно из исходного кода, напримерRstudio. НАСКОЛЬКО МНЕ ИЗВЕСТНО,Texmakerтакже может справиться с этим.

Связанный контент