Я знаю о overlayfs, что он рассматривает нижний каталог как доступный только для чтения и copy_up, когда мы хотим изменить нижний файл
так есть ли способ изменить нижний файл и скопировать измененный файл в нижний каталог?
От https://www.kernel.org/doc/Documentation/filesystems/overlayfs.txt
Изменения в базовых файловых системах, когда они являются частью смонтированной файловой системы оверлея, не допускаются. Если базовая файловая система изменена, поведение оверлея не определено, хотя это не приведет к сбою или взаимоблокировке.