☰

Скопировать часть содержимого предыдущей строки в следующую

tag-icon • tag-icon text-processing cygwin
Скопировать часть содержимого предыдущей строки в следующую

У меня есть файл со следующей структурой:

GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952
alt_id: GO:0050876
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity

Там, где это сказано, alt_idэто означает, что это альтернатива предыдущему GO:коду. Я хотел бы добавить к каждому alt_idопределение предыдущего GO:, то есть я хочу вывод вроде этого:

GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952     reproduction
alt_id: GO:0050876     reproduction
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013      obsolete thioredoxin
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity

Как скопировать содержимое предыдущей строки в следующую? Я работаю с Cygwin в среде Windows.

решение1

С awk, не уверен, будет ли он работать наCygwin

$ awk '{ if(/^alt_id/){$0 = $0" "p} else{p = ""; for (i=2; i<=NF; i++) p = p" "$i} } 1' ip.txt
GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952  reproduction
alt_id: GO:0050876  reproduction
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013  obsolete thioredoxin
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity
  • Для каждой строки, не совпадающей alt_idв начале строки, используйте переменную ( p), чтобы сохранить все столбцы, начиная со второго.
  • Если строка совпадает alt_idс началом строки, добавить содержимое pпеременной к входной строке, содержащейся в $0переменной
  • Финальный вариант 1— это кратчайший путь для печати содержимого$0

решение2

Эту задачу можно легко выполнить,сед

sed '
    N  #append next line (operate with `line1\nline2`);
    /\nalt_id/s/\([^0-9]*\)\n.*/&\1/
       #if next line starts with `alt_id` the append end of present line
    P  #print present line (all before `\n`)
    D  #remove all before `\n`, starts from begin with remain part (line2)
    ' file

Другой способ — использовать hold-space.

sed '
    /^alt_id:/G #if line starts by `alt_id:` append hold-space
    s/\n//      #remove `\n`ewline symbol
    t           #if removing success pass further commands (go to end)
    h           #if no (for other lines) copy it to hold-space
    s/\S*//     #remove all non-space symbols from start till first space
    x           #exchange hold-space and pattern-space ==
                #+put resedue into hold-space and return full line
    ' file

Связанный контент