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如何使用 wget/curl 透過命令列下載 ebi fastq 鏈接

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如何使用 wget/curl 透過命令列下載 ebi fastq 鏈接

我有大量資料（fastq）要從 ENA 資料庫下載。

Example: ERS076383 ERS012262 ERS160574 ERS349280 etc

Link to download via browser: 

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt

現在我將連結取代accession=一一下載對應的txt，然後我將使用wget下載與fastq關聯的每個ftp連結。但我無法透過 wget 下載它。

i tried: 

wget https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
[1] 61380
[2] 61381
[3] 61382

Redirecting output to 'wget-log'....

但它不起作用。

答案1

您需要將網址放在引號中，如下所示：

wget 'https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt'

或轉義 & 符號 ( \&)。

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