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需要協助處理在 ImageJ 中開啟的圖像

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需要協助處理在 ImageJ 中開啟的圖像

我創建了一個巨集（基於我見過的不同巨集），用於分析圖片中的粒子區域，自動將結果視窗中的「區域」列複製到剪貼簿，並顯示一個窗口，詢問我是否要關閉每個視窗。

我想知道是否可以將此巨集應用於在 ImageJ 中開啟的圖片並在單一結果視窗中獲取所有結果（主要是區域）。我無法使用批次功能，因為我的資料夾包含多組圖片，這些圖片必須彼此分開分析（不同的微生物菌株），以便分別獲得每個​​菌株的結果。

這是我目前的宏，我知道它很難看，但效果相當好：

run("8-bit");
run("Threshold...");
waitForUser;
getThreshold(lower,upper);
if (lower==-1)
    exit("Threshold was not set");
run("Convert to Mask");
run("Fill Holes");
run("Set Scale...", "distance=2.87 known=1 unit=µm global");
run("Analyze Particles...", "size=30-Infinity display exclude add");
close();
closeWin("ROI Manager");
closeWin("Threshold");
closeWin("Log");
String.resetBuffer;
  for (i=0; i<nResults; i++)
      String.append(getResult("Area", i) + "\n");
  String.copy(String.buffer);
waitForUser("Work done", "WORK DONE: Close all windows?");
if (isOpen("Results")) {
         selectWindow("Results"); 
         run("Close" );

function closeWin(winName)
{
    if (isOpen(winName)) 
    {
        selectWindow(winName);
        run("Close");
    }
}

答案1

最後我能夠做到這一點，如果有人有興趣的話，這是代碼：

for (i=1; i<=nImages; i++) {
    selectImage(i);
    run("8-bit");
    run("Threshold...");
    waitForUser;
    getThreshold(lower,upper);
    if (lower==-1)
        exit("Threshold was not set");
    run("Convert to Mask");
    run("Fill Holes");
    run("Set Scale...", "distance=2.87 known=1 unit=µm global");
    run("Analyze Particles...", "size=30-Infinity display exclude add");
}
close("*");
closeWin("ROI Manager");
closeWin("Threshold");
closeWin("Log");
String.resetBuffer;
  for (i=0; i<nResults; i++)
      String.append(getResult("Area", i) + "\n");
  String.copy(String.buffer);
waitForUser("Work done", "WORK DONE: Close all windows?");
if (isOpen("Results")) {
         selectWindow("Results"); 
         run("Close" );

function closeWin(winName)
{
    if (isOpen(winName)) 
    {
        selectWindow(winName);
        run("Close");
    }
}

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