如何用另一個文件中的匹配字串替換一個文件中的匹配字串?

如何用另一個文件中的匹配字串替換一個文件中的匹配字串?

我有一個這樣的文件:

head cleandata.map
1   1:775852:T:C    0   775852
1   1:1120590:A:C   0   1120590
1   1:1145994:T:C   0   1145994
1   1:1148494:A:G   0   1148494
...

還有另一個文件:

head lifted.map
1   1:775852:T:C    0.0 785989
1   1:1120590:A:C   0.0 1130727
1   1:1145994:T:C   0.0 1156131
1   1:1148494:A:G   0.0 1158631
...

我想要得到的是更改 cleandata.map ,它看起來像這樣:

1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631
...

因此,如果lift.map 第2 列中的行與cleandata.map 第2 列中的行匹配,請將cleandata.map 第2 列和第4 列中的行替換為lift.map 中第4 列的值。

答案1

嘗試

$ awk 'FNR==NR {T[$2] = $4; next} $2 in T {gsub ($4, T[$2])} 1' file2 file1
1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631

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