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排序用 NA 取代列值

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排序用 NA 取代列值

我一直在嘗試對這個文件進行排序，但我的第一列中不斷出現 NA，但我不知道為什麼。

> head Coch_ATAC_peaks.bed
chr1    3181385 3181783
chr1    3389977 3390375
chr1    3456575 3456973
chr1    3661505 3661903
chr1    3903684 3904082
chr1    3916303 3916701
chr1    4316903 4317301
chr1    4322506 4322904
chr1    4402488 4402886
chr1    4416984 4417382

> sort -k 1,1V Coch_ATAC_peaks.bed | head
NA      1050187 1050585
NA      110317  110715
NA      127371  127769
NA      128207  128605
NA      13412   13810
NA      159542  159940
NA      193109  193507
NA      223382  223780
NA      233951  234349
NA      252365  252763

我最初是在 Windows PC 上製作這個文件的。我用 dos2unix 將其轉換為 UNIX。你知道這些 NA 是從哪裡來的嗎？

答案1

請參閱 αГsнιn 的評論。我希望 NA 能夠按順序建立；然而它們一直存在於文件中。

> grep NA Coch_ATAC_peaks.bed
NA      2745    3143
NA      5650    6048
NA      9679    10077
NA      13412   13810
NA      39048   39446
NA      43021   43419
NA      55564   55962
NA      69578   69976
NA      110317  110715
NA      127371  127769

一旦 NA 被移除，上游就會 > sort -k 1,1 Coch_ATAC_peaks.bed 按預期工作。

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