如何對多個文件運行單一命令來轉換文件格式？

Question

我正在嘗試將文件格式轉換為fa在Linux 終端機上fq使用。seqkit命令很簡單，如下圖所示。

seqkit fq2fa Std_metabat2_bin.9_sub.fa -o Std_metabat2_bin.9_sub.fq -j 20 

但是，我有超過 200 個檔案（fa元基因組箱的檔案），我想知道是否有比一次轉換一個檔案更好的方法。

Answer 1

一種解決方案是使用for循環來轉換.fa目錄中的所有檔案：

for file in *.fa; do seqkit fq2fa "$file" -o $(basename "$file" .fa).fq -j 20; done