☰

Perl-最小值和最大值

tag-icon • tag-icon perl
Perl-最小值和最大值

輸入檔

Xm_ABL1 Geneious    extracted region    1   168 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3512970000000 -> 3514640000000"
Xm_ABL1 Geneious    extracted region    169 334 .   +   .   Name=Extracted region from gi|371443098|gb|JH556762.1|;Extracted interval="3717850000000 -> 3719500000000"

Perl 程式碼的一部分

 if ($array[1] =~ /extracted region/){
            die "No CDS record for $key!\n" unless $metadata->{$key};
    (my $label = $array[7]) =~ s/.*region from (.*)\|;.*/$1/;
    $label =~ s/\|/_/g;
    $group->{$label} ||= { 
            pos1 => 1e10,
            pos2 => 0,
            metadata => $metadata->{$key},
            sequences => [],
    };
    (my $pos1, my $arr, my $pos2) = ($array[7]=~/.*interval=\"(\d+) (<?->?) (\d+)\"$/gm);
    # capture hi/lo values for group
    $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if $pos1 < $group->{$label}->{pos1};
    $group->{$label}->{pos2} = $pos2 if $pos2 > $group->{$label}->{pos2};
    # push this sequence onto the group's array
    push(@{ $group->{$label}->{sequences} }, [ $pos1, $pos2, $arrow->{$arr} ]);
}

在代碼中 $pos1=3512970000000,3717850000000 & $pos2=3514640000000,3719500000000。我的程式碼會列印新行查找最小值和最大值（如果 $pos1 小於 10,000），但如果該值大於 10,0000，則會在列印 pos1 的最小值時出錯。在調試中查找 $pos1 的最小值和 $pos2 的最大值時，我們將不勝感激。

答案1

$group->{$label}->{pos1}總是被定義的，你用第 6 行初始化它：

pos1 => 1e10,

這樣，它就可以正常工作，直到$pos1 <= 1e10。如果您想要列印最小值$group->{$label}->{pos1} = 3512970000000（如範例輸入），則必須初始化$group->{$label}->{pos1} = -1（第 6 行）：

pos1 => -1,

並將第 13 行修改為：

$group->{$label}->{pos1} = $pos1 if (($group->{$label}->{pos1} < 0) || ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

答案2

透過更改第 13 行的程式碼：使用 defiend

 $group->{$label}->{pos1} = $pos1 if ((!defined $group->{$label}->{pos1})
 ||  ($pos1 < $group->{$label}->{pos1}));

相關內容