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我想用不同的顏色來突出一些代表蛋白質氨基酸序列的字母。下面的程式碼工作正常，但突出顯示的方塊並不完全適合字母，正如您在 MWE 輸出中看到的那樣，它稍微向字母底部移動並且不居中，那麼如何證明它位於字母的中心字母？

MWE代碼

\documentclass{scrartcl}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{fontspec}

\setmonofont[Scale=MatchLowercase]{Inconsolata}
\usepackage{xcolor,graphicx}
\definecolor{set1}{RGB}{200,200,200}
\definecolor{set2}{RGB}{102,255,102}
\usepackage{soul} % for highlighting  
\newcommand{\hlc}[2][yellow]{{\sethlcolor{#1}\hl{#2}}}
\newfontfamily\myfont[Scale=MatchUppercase]{Inconsolata} % monospace font 
\newenvironment{protseq}{\myfont}{\par} 

\begin{document}
\begin{protseq}
\begin{tabular}{lr}
\hlc[set2]{MLGSRAVMLL LLLPWTAQG}R AVPGGSSPAW TQCQQLSQ\hlc[set1]{K}L CTLAWSAHPL & 50\\
VGHMDLREEG DEETTNDVPH IQCGDGCDPQ GLRDNSQFCL QRIHQGLIFY & 100\\
E\hlc[set1]{K}LLGSDIFT GEPSLLPDSP VGQLHASLLG LSQLLQPEGH HWETQQIPSL &    150\\
SPSQPWQRLL LRF\hlc[set1]{K}ILRSLQ AFVAVAARVF AHGAATLSP & 189\\
\end{tabular}
\end{protseq}
\end{document}

MWE輸出

在此輸入影像描述

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使用 Stephan Lehmke 的答案，即使使用Inconsolata字體和對齊方式也被保留，問題也得到解決，真是太神奇了！

在此輸入影像描述

答案1

奇怪的是，soul對於調整「突出顯示斑點」的位置並沒有提供太多幫助。

透過將其添加到序言中，您可以調整垂直位置：

\usepackage{etoolbox}

\newdimen\hladdbelow
\newdimen\hladdabove

\makeatletter
\apptocmd\SOUL@hlpreamble
{%
  \advance\SOUL@uldp\hladdbelow
  \advance\SOUL@ulht\hladdabove
}{}{}
\makeatother

\hladdbelow-2pt
%\hladdabove1pt

解釋：這三個soul命令\ul、\st和\hl基本上使用相同的程式碼，只是為尺寸\SOUL@uldp（「突出顯示區塊」的深度）和\SOUL@ulht（「突出顯示區塊」的高度）選擇不同的值。

\SOUL@hlpreamble（由\hl）根據字體大小「智慧」來決定這些值，但不提供調整介面。因此，我引入了新的尺寸\hladdabove（添加到頂部的長度）和\hladdbelow（添加到底​​部的長度），它們是在原始確定之後添加的。

事實上，在底部去掉一點似乎就足夠了（因此，\hladdbelow-2pt），但如果您想要不同的調整，您可以嘗試這些值。

此處顯示的設定產生（使用cmtt字體）：

在此輸入影像描述

答案2

您可以使用 just\colorbox代替\hl，假設突出顯示的序列不會在行尾換行：

\newcommand{\hlc}[2][yellow]{{\fboxsep1pt\colorbox{#1}{#2}}}

在此輸入影像描述

我沒有Inconsolata字體，所以我改變了。

\documentclass{scrartcl}
\usepackage[T1]{fontenc}
%\usepackage{fontspec}
%
%\setmonofont[Scale=MatchLowercase]{Inconsolata}
\usepackage{xcolor,graphicx}
\definecolor{set1}{RGB}{200,200,200}
\definecolor{set2}{RGB}{102,255,102}
\usepackage{soul} % for highlighting
\newcommand{\hlc}[2][yellow]{{\fboxsep1pt\colorbox{#1}{#2}}}
%\newfontfamily\myfont[Scale=MatchUppercase]{Inconsolata} % monospace font
\newenvironment{protseq}{\ttfamily}{\par}

\begin{document}
\begin{protseq}
\begin{tabular}{lr}
\hlc[set2]{MLGSRAVMLL LLLPWTAQG}R AVPGGSSPAW TQCQQLSQ\hlc[set1]{K}L CTLAWSAHPL & 50\\
VGHMDLREEG DEETTNDVPH IQCGDGCDPQ GLRDNSQFCL QRIHQGLIFY & 100\\
E\hlc[set1]{K}LLGSDIFT GEPSLLPDSP VGQLHASLLG \hlc[set2]{LSQLLQPEGH HWETQQIPSL &    150\\
SPSQPWQRLL LRF\hlc[set1]{K}ILRSLQ AFVAVAARVF AHGAATLSP & 189\\
\end{tabular}
\end{protseq}
\end{document}

答案3

顯然，該巨集\hl{}包含一個\strut來調整框深度，以便當它包含帶有下伸部的字元（例如Q）和不包含下伸部的字元時，它具有相同的深度。這樣保證了盒子的高度一致。

然而，也許對於所選的字體來說，深度似乎有點太大了。

如果您使用 tikz，您可以更好地控制結果（這對這個問題來說確實是矯枉過正）。這是一個解決方案：

\documentclass{scrartcl}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{fontspec}
\usepackage{tikz}

\setmonofont[Scale=MatchLowercase]{Inconsolata}
\usepackage{xcolor,graphicx}
\definecolor{set1}{RGB}{200,200,200}
\definecolor{set2}{RGB}{102,255,102}
\newfontfamily\myfont[Scale=MatchUppercase]{Inconsolata} % monospace font
\newenvironment{protseq}{\myfont}{\par}

\newcommand{\hlc}[2][yellow]{\tikz[baseline=(T.base)]
   \node[inner ysep=1pt, inner xsep=0pt, fill=#1](T){\vphantom{Q}#2};}

\begin{document}
\begin{protseq}
\begin{tabular}{lr}
\hlc[set2]{MLGSRAVMLL LLLPWTAQG}R AVPGGSSPAW TQCQQLSQ\hlc[set1]{K}L CTLAWSAHPL & 50\\
VGHMDLREEG DEETTNDVPH IQCGDGCDPQ GLRDNSQFCL QRIHQGLIFY & 100\\
E\hlc[set1]{K}LLGSDIFT GEPSLLPDSP VGQLHASLLG LSQLLQPEGH HWETQQIPSL &    150\\
SPSQPWQRLL LRF\hlc[set1]{K}ILRSLQ AFVAVAARVF AHGAATLSP & 189\\
\end{tabular}
\end{protseq}
\end{document}

結果

我曾經\vphantom{Q}實現過與 相同的目標\strut，但該解決方案產生的框架深度更短。您也可以刪除\vphantom{Q}，以便框的深度完全適合其內容，但這會為 Q 和 K 產生不同的框深度，恕我直言，這看起來不太好。

使用TikZ的好處是可以輕鬆實現其他效果，例如圓角、不規則邊緣等。

\newcommand{\hlc}[2][yellow]{\tikz[baseline=(T.base)]
   \node[inner ysep=1pt, inner xsep=0pt, fill=#1, rounded corners=2pt](T){\vphantom{Q}#2};}

產生：

結果2

和

\usetikzlibrary{decorations.pathmorphing}

\newcommand{\hlc}[2][yellow]{\tikz[baseline=(T.base)]
\node[inner ysep=1pt, inner xsep=0pt, fill=#1, decorate,
   decoration={random steps, amplitude=1pt, segment length=0.5ex}](T){\vphantom{Q}#2};}

產生：

結果3

這很醜陋，但顯示了可能性:-)

更新

請注意，如果您對突出顯示斑點的形狀太過瘋狂，則與周圍文字的對齊可能會受到影響。可以透過將 tikz 繪圖的邊界框精確設定為突出顯示文字的形狀來解決此問題，從而允許「斑點」溢出此邊界框。

下面的例子更清楚地說明了我的意思：

\newcommand{\hlc}[2][yellow]{\tikz[baseline=(TT.base)]{
   \node[inner sep=0pt](TT){\vphantom{Q}#2};  % rectangle with the text to highlight
   \useasboundingbox (TT.south west) rectangle (TT.north east);
   \node[inner xsep=2pt, inner ysep=1pt, fit=(TT)] (T){}; % rectangle with the highlighting blob
   % now draw arbitrary shapes based on the last rectangle
   \fill[#1, opacity=0.5] (T.north west) to[out=5, in=185] (T.north east)
          -- (T.south east) to[out=190, in=10] (T.south west) -- cycle;
}}

結果：

結果4

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