過去（TeXworks v0.4.0 r.759 / MikTeX 2.9）我使用以下 texify 選項來通知 texify 其他輸入檔的位置：
--tex-option=-include-directory=C:\TexInputFiles\
這也導致 bibtex 找到額外的 .bib 檔案。
現在，在版本 0.4.6（MiKTeX 2.9 64 位元）中，相同的 texify 選項僅允許 Latex 尋找其他樣式和其他輸入檔。有一個 LaTeX 警告抱怨“輸入行 XX 上的空‘thebibliography’環境”和 bibtex 報告（在 .blg 文件中）：“我無法打開資料庫文件 XXX”。
我可以單獨使用 -include-directory=C:\TexInputFiles\ 來表示 pdfLaTeX 和 BibTeX，然後手動呼叫 pass 來提供所需的結果，即 bibtex 找到 .bib 檔案。
然而，似乎 texify 曾經將「--tex-option=」值傳遞給 bibtex 以及 Latex，但現在只對 Latex 這樣做。那可能嗎？
有沒有機會解決這個問題或有解決方法嗎？
我嘗試將環境變數 BIBINPUTS 和 TEXINPUTS 設定為 C:\TexInputFiles\ （和 C:\TexInputFiles\）（在系統 | 環境變數 | 系統變數中），但在 Windows 下環境變數似乎總是被忽略。