
當運行命令時:
cellprofiler --get-batch-commands "/users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5"
在 shell 中,我得到一個輸出:
CellProfiler -c -r -b -p /users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5 -g Metadata_Plate=20140602-LOPAC pilot_Assay Plate 0_5
CellProfiler -c -r -b -p /users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5 -g Metadata_Plate=20140602-LOPAC pilot_Assay Plate 0_6
CellProfiler -c -r -b -p /users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5 -g Metadata_Plate=20140602-LOPAC pilot_Assay Plate 0_7
CellProfiler -c -r -b -p /users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5 -g Metadata_Plate=20140602-LOPAC pilot_Assay Plate 0_8
但是,當我嘗試將其輸出到文件(我添加>test.txt
)時,我得到一個空文件。我還嘗試透過 python 呼叫該命令並獲得空的標準輸出。在這兩種情況下,stderr 也是空的。
問題是什麼?有任何想法嗎?
答案1
有些程式在連接到終端機時和未連接到終端時的行為有所不同(請參閱isatty
功能)。要使應用程式認為它已連接到終端,您可以嘗試script -c
:
script -c cellprofiler --get-batch-commands \
"/users/pmrotem/CellProfiler/example_project/output/Batch_data5_8.h5" \
>test.txt